Microscópio Eletrônico de Transmissão (MET): Neste microscópio o feixe de elétrons atravessa a célula e forma a imagem em uma tela fluorescente,  dando  detalhes de moléculas, organelas  e estruturas intracelulares, tendo capacidade de produzir imagens de alta resolução e ampliação (até 300 mil vezes).

Microscópio Eletrônico de Varredura (MEV): A formação de imagem deste microscópio é feita com os elétrons que varrem a superfície das estruturas biológicas.   Deste modo, este microscópio nos fornece uma imagem da superfície, com noções de profundidade e tridimensionalidade e seu limite de resolução é cerca de 0.3nm.